Hoewel de WaterRower beschermhoes veel voordelen biedt, zijn er ook beperkingen waar je rekening mee moet houden. Ten eerste is de hoes niet bedoeld voor buitengebruik of om het toestel te beschermen tegen directe blootstelling aan regen of hevige vochtigheid. Als je de roeitrainer in een onverwarmde of slecht geventileerde ruimte plaatst waar temperatuurschommelingen en condensatie optreden, kan langdurig afdekken juist leiden tot ophoping van vocht rondom het hout. Dit kan op lange termijn nadelig zijn voor de afwerking en het hout, dus ventilatie en droge opslag blijven belangrijk.
Een ander nadeel is de beperkte compatibiliteit: de hoes past niet op WaterRower-modellen met XL-rails. Dat kan verwarrend zijn voor kopers die niet precies het model kennen dat zij bezitten, en het betekent dat je vooraf goed moet controleren of jouw toestel geschikt is. Daarnaast is de hoes redelijk enkel in kleur en ontwerp; als je op zoek bent naar een esthetische, op maat gemaakte of kleurrijke oplossing, biedt dit accessoire weinig keuzemogelijkheden.
Ten slotte, hoewel de hoes stof en lichte vochtigheid tegenhoudt, biedt hij geen volledige bescherming tegen huisdieren of scherpe objecten. Katten of honden kunnen alsnog krassen veroorzaken als zij op of onder de hoes springen, en scherpe randen kunnen de stof beschadigen. Voor huishoudens met huisdieren of kleine kinderen is dat iets om rekening mee te houden.